[Mario]

Hola Cris,
Largas colas, en la frontera con Bosnia dirección Dubrovnik – Split, a veces, se forman los domingos cuando los turistas vuelven de las vacaciones. Y, dirección Split – Dubrovnik, los viernes y sábados cuando empiezan sus vacaciones.
Así que, podéis viajar con el transporte publico o alquilar un coche (con cual ahorraras bastante tiempo pasando desde un lugar hasta otro).
Yo dedicaría a Dubrovnik solo una noche, ver el casco antiguo durante el día, y después seguir la ruta.
Dudo que en Plitvice existe algún lugar donde os podéis bañar «legalmente».
En el Parque Nacional Krka, si, podéis bañaros. Supongo que, exactamente, las imágenes que has visto eran del Parque nacional Krka.
Parque Nacional Plitvice podéis visitar en un día…elegir ruta de 4-6 o 8-10 horas y no merece la pena, el día después, otra vez visitar de nuevo el parque y pagar otra vez la entrada (18 euros).
Por fin, si decides viajar con el transporte publico, te recomiendo el barco de la compañía «Kapetan Luka», o, en la dirección hacia Plitvice, o volviendo hacia Dubrovnik haciendo las paradas en las islas Brac, Hvar, Korcula, Mljet – Dubrovnik.
Los horarios:

Un saludo.